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世界首个野生梨基因组图谱绘制完成

2021-09-29 09:36:25 来源:网络 责任编辑:
  日前,《植物生物技术杂志》在线发布了全球首个野生梨高品质基因组图片。该研究成果由中国农业科学院果树研究所研究员曹玉芬团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜团队等合作完成。
  科研人员以山西杜梨为材料,结合PacBio三代测序、Bionano光学图像、Hi-C技术,组装了高质量杜梨参考基因组序列,是中国在梨基因组学研究领域的重大研究进展。
  据介绍,杜梨基因组装大小为532.7Mb,contigN50为1.57Mb,共59552个蛋白质编码基因和247.4Mb重复序列备注,通过BUSCO评估基因组的完整性,完整性达到95.9%。杜梨基因组中共鉴定了573个NBS类型的抗病基因,其中150个是TNL类型的抗病基因,在已发布的玫瑰科基因组中数量最多,说明了杜梨作为野生种类的强抗病性。
  驯化过程中,梨属植物果实的酸味逐渐消失,研究表明梨原花青素合成结构基因复印件数比白梨明显多,影响原花青素的积累。同时,花青素还原酶代谢渠道是原花青素合成的唯一途径,山梨醇转运蛋白跨膜转运可能是影响可溶性有机物积累的主要因素。

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